Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARHGEF10O15013 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF10O15013 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms