Protein–RNA interactions for Protein: O14994

SYN3, Synapsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3O14994 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYN3O14994 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SYN3O14994 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SYN3O14994 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYN3O14994 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms