Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PHOX2AO14813 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms