Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXLO00592 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXLO00592 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXLO00592 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PODXLO00592 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PODXLO00592 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PODXLO00592 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms