Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
AGRNO00468 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
AGRNO00468 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms