Protein–RNA interactions for Protein: O00409

FOXN3, Forkhead box protein N3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3O00409 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN3O00409 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN3O00409 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms