Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01387J3KSC0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01387J3KSC0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms