Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
B4DGG1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
B4DGG1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
B4DGG1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
B4DGG1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
B4DGG1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DGG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DGG1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DGG1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
B4DGG1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms