Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC169A6NNP5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC169A6NNP5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms