Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GOLGA6L9A6NEM1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GOLGA6L9A6NEM1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms