Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LCHNA4D1U4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LCHNA4D1U4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms