Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CPED1A4D0V7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CPED1A4D0V7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms