Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FRMD3A2A2Y4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251.1 ms