Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
POTEB3A0JP26 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
POTEB3A0JP26 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms