Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q8

GTF3C5, General transcription factor 3C polypeptide 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5Q9Y5Q8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C5Q9Y5Q8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms