Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAXBP1Q9Y5B6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAXBP1Q9Y5B6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms