Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FARP1Q9Y4F1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
FARP1Q9Y4F1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms