Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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HECTD4Q9Y4D8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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HECTD4Q9Y4D8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HECTD4Q9Y4D8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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