Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HCN4Q9Y3Q4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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HCN4Q9Y3Q4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HCN4Q9Y3Q4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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