Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y247

FAM50B, Protein FAM50B, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM50BQ9Y247 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM50BQ9Y247 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM50BQ9Y247 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms