Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRPC6Q9Y210 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRPC6Q9Y210 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms