Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HHLA3Q9XRX5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms