Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CEP164Q9UPV0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CEP164Q9UPV0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CEP164Q9UPV0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms