Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PNMA2Q9UL42 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PNMA2Q9UL42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms