Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CPA4Q9UI42 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CPA4Q9UI42 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms