Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms