Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SWAP70Q9UH65 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SWAP70Q9UH65 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms