Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
APOBEC3BQ9UH17 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOBEC3BQ9UH17 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms