Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM5BQ9UGL1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM5BQ9UGL1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM5BQ9UGL1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms