Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
VTI1BQ9UEU0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms