Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CLIP2Q9UDT6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLIP2Q9UDT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms