Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CLN8Q9UBY8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms