Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXF1Q9UBU9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXF1Q9UBU9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms