Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms