Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MBD2Q9UBB5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms