Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
CCDC180Q9P1Z9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC43.13■■■■■ 4.5
CCDC180Q9P1Z9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CCDC180Q9P1Z9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms