Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHRF1Q9P1Y6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHRF1Q9P1Y6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms