Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZNRD1Q9P1U0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNRD1Q9P1U0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 703.9 ms