Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CXXC1Q9P0U4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXXC1Q9P0U4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms