Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNA2D2Q9NY47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNA2D2Q9NY47 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms