Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BARHL2Q9NY43 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BARHL2Q9NY43 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
BARHL2Q9NY43 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms