Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CWC25Q9NXE8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms