Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DDIT4Q9NX09 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDIT4Q9NX09 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms