Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
IFT57Q9NWB7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
IFT57Q9NWB7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms