Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
DDX18Q9NVP1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DDX18Q9NVP1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms