Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPTLC3Q9NUV7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPTLC3Q9NUV7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPTLC3Q9NUV7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms