Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HELLSQ9NRZ9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms