Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TULP4Q9NRJ4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms