Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRTAC1Q9NQ79 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRTAC1Q9NQ79 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms