Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
LHX9Q9NQ69 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms